A matéria que deve constar do curso de Marinheiro foi regulamentada pela Portaria 288 / 2000, sendo a seguinte:

Parte teórica

Conhecer os aspectos aplicáveis do Regulamento da Náutica de Recreio;
Capacidades conferidas pela carta de marinheiro;
Documentação e impostos obrigatórios;
Vistorias;
Distâncias mínimas a manter ao navegar ao longo de praia;
Navegação em águas interiores
Características fundamentais de uma embarcação;
Tipos de embarcação de recreio;
Nomenclatura e palamenta das pequenas embarcações;
Meios de propulsão e de governo;
Embarcações miúdas; nomenclatura e palamenta;
Generalidades sobre marés, correntes e ventos. Consultar uma tabela de marés;
Generalidades sobre âncoras e amarras; sua manobra
Manobra de fundear. Natureza do fundo. Escolha de fundeadouro;
Regras básicas de navegação para evitar abalroamentos. Noção de marcação constante;
Noções básicas de governo e manobra. Balizagem;
Segurança a bordo. Segurança individual e da embarcação;
Conhecimentos elementares de meteorologia. Escala de Beauford;
Noções básicas de primeiros socorros;
Conhecimentos sumários de cerimonial marítimo;
Conhecimentos básicos de comunicações no serviço móvel marítimo. Noção de procedimentos de socorros e urgência;
Conhecimento do significado das bandeiras "A" e "B" do Código Internacional de Sinais;
Noções genéricas sobre motores. Manutenção pelo utilizador;
Preservação do meio ambiente marinho. Cuidados a ter com óleos queimados, águas residuais, resíduos não biodegradáveis, utilização de óleos biodegradáveis.
Parte prática
Aparelhar uma embarcação a remos, à vela ou a motor;
Condução de uma embarcação a remos, à vela ou a motor;
Manobra de homem ao mar; recolha de uma bóia simulando o náufrago;
Manobras de atracar e abicar;
Manobra de atracar e largar de uma bóia ou de uma embarcação;
Prevenção e combate a incêndios; utilização de extintores;
Trabalhos elementares de arte de marinheiro;
Noções básicas de utilização e manutenção de motores.